Der Psychologische Fachdienst ist in allen drei Regionen der Stiftung vertreten und unterstützt die pädagogische Arbeit der Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter. Er  unterstützt die pädagogische Arbeit der Mitarbeiter durch regelmäßige Fachberatung in den Teams und Schulen der Einrichtung, bei der Beratung einzelner Mitarbeiter, der Teamentwicklung und Supervision. Er wirkt an der konzeptionellen Weiterentwicklung der Angebote und Durchführung von Fortbildungsangeboten mit und begleitet Hilfeprozesse.

Im direkten Kontakt mit den betreuten Kindern, Jugendlichen, jungen Erwachsenen und deren Herkunftsfamilien arbeitet der Psychologische Fachdienst in den Bereichen Aufnahmeanamnese, psychologische Diagnostik, Therapie von Kindern, Jugendlichen und jungen Erwachsenen, Einzelberatung für Kinder, Jugendliche und junge Erwachsene und Beratung von Eltern und Familien.

Er nutzt für seine Beratungs- und Therapieangebote schwerpunktmäßig traumatherapeutische und traumapädagogische Ansätze, tiefenpsychologisch fundierte Psychotherapie, Verhaltenstherapie, systemisch orientierte Therapie und Beratung, heilpädagogische Spieltherapie, tiergestützte Therapie, Video-Home-Training und PART (Professionelles Handeln in Gewaltsituationen).